AZV NW25J-03-00098

Charakterizace subtypů leukemických buněk zodpovědných za agresivitu a relaps Ph+ leukémií na úrovni jedné buňky

2025 – 2028

V terapii Ph+ leukemií hrají zásadní roli tyrozinkinázové inhibitory (TKI) cílící onkoprotein BCR::ABL1, které signifikantně zlepšily průběh chronické myeloidní leukémie (CML) a Ph+ akutní lymfoblastické leukémie (Ph+ ALL) a celkové přežití pacientů. Výzvou však stále zůstává, jak předejít progresi obou onemocnění. U Ph+ ALL jsou problémem agresivní relapsy, u CML se jedná o progresi do blastického zvratu, což jsou v obou případech stavy, které vyžadují inovativní terapeutické přístupy kombinující TKI s dalšími preparáty. V navrhovaném projektu pracujeme s hypotézou, že sekvenování nové generace na úrovni jedné buňky identifikuje leukemické buňky zodpovědné za progresi Ph+ leukémií, umožní charakterizovat jejich molekulární pozadí a terapeutické cíle. Cílem tohoto projektu je identifikovat buněčné subpopulace zodpovědné za rozvoj rezistence a progresi onemocnění a také zjistit, jak odlišit lymfoblastický zvrat CML, Ph+ ALL a Ph+ MPAL v době určení diagnózy. Metodicky se zaměříme na RNA-seq na úrovni jedné buňky se současnou analýzou povrchových markerů. Budeme pracovat s buňkami v době relapsu onemocnění (u CML se bude jednat o blastický zvrat myeloidní nebo/a lymfoidní) a s buňkami z párového vzorku z doby diagnózy. Pro studium odlišení Ph+ leukémií v době diagnózy budeme pracovat s primárními buňkami pacientů.